Tema 10 · Integració – MiniSuite Bioinformàtica

// proteina.h
#ifndef PROTEINA_H
#define PROTEINA_H

#define MAX_NOM 100
#define MAX_SEQ 10000

typedef struct {
    char nom[MAX_NOM];
    char sequencia_adn[MAX_SEQ];
    char sequencia_proteina[MAX_SEQ/3];
    int longitud_adn;
    int longitud_proteina;
    float gc_percent;
    int freq_a, freq_c, freq_g, freq_t;
} Proteina;

// Funcions per inicialitzar i alliberar
Proteina* crear_proteina(const char *nom, const char *adn);
void alliberar_proteina(Proteina *p);

#endif

// fasta.c
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>
#include "proteina.h"

Proteina** llegir_fasta(const char *nom_fitxer, int *num_proteines) {
    FILE *f = fopen(nom_fitxer, "r");
    if (!f) {
        printf("Error: no s'ha pogut obrir %s\n", nom_fitxer);
        return NULL;
    }

    // Array dinàmic de punters a Proteina
    int capacitat = 10;
    Proteina **llista = malloc(capacitat * sizeof(Proteina*));
    *num_proteines = 0;
    
    char linia[MAX_SEQ];
    char nom_actual[MAX_NOM] = "";
    char sequencia[MAX_SEQ] = "";
    int llegint_seq = 0;

    while (fgets(linia, MAX_SEQ, f)) {
        linia[strcspn(linia, "\n")] = '\0';  // eliminar salt de línia
        
        if (linia[0] == '>') {
            // Si ja teníem una proteïna anterior, la guardem
            if (llegint_seq && strlen(sequencia) > 0) {
                llista[*num_proteines] = crear_proteina(nom_actual, sequencia);
                (*num_proteines)++;
                sequencia[0] = '\0';
            }
            strcpy(nom_actual, linia + 1);  // saltar el '>'
            llegint_seq = 1;
        } else if (llegint_seq) {
            strcat(sequencia, linia);
        }
    }
    // Guardar l'última proteïna
    if (llegint_seq && strlen(sequencia) > 0) {
        llista[*num_proteines] = crear_proteina(nom_actual, sequencia);
        (*num_proteines)++;
    }
    
    fclose(f);
    return llista;
}

// main.c (esquema del menú)
#include <stdio.h>
#include "proteina.h"
#include "fasta.h"
#include "analisi.h"
#include "comparacio.h"
#include "informe.h"

int main() {
    Proteina **llista = NULL;
    int num_prot = 0;
    int opcio;

    printf("=== MiniSuite Bioinformàtica ===\n");
    printf("1. Carregar fitxer FASTA\n");
    printf("2. Mostrar estadístiques\n");
    printf("3. Traduir ADN a proteïna\n");
    printf("4. Comparar dues proteïnes\n");
    printf("5. Exportar informe\n");
    printf("0. Sortir\n");

    do {
        printf("\nOpció: ");
        scanf("%d", &opcio);
        // switch amb crides a les funcions dels mòduls
    } while (opcio != 0);

    // Alliberar memòria
    for (int i = 0; i < num_prot; i++)
        alliberar_proteina(llista[i]);
    free(llista);
    return 0;
}